Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN2AP42771 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2AP42771 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms