Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPOP42166 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPOP42166 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms