Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms