Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms