Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms