Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCD1P33897 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCD1P33897 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms