Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPS1P31327 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPS1P31327 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPS1P31327 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms