Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP1P29466 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms