Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTKP29376 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTKP29376 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTKP29376 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTKP29376 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTKP29376 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTKP29376 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTKP29376 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTKP29376 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTKP29376 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTKP29376 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTKP29376 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTKP29376 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTKP29376 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTKP29376 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTKP29376 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTKP29376 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTKP29376 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTKP29376 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms