Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms