Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms