Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PLNP26678 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms