Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KDELR1P24390 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KDELR1P24390 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms