Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms