Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B1P20020 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B1P20020 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2B1P20020 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2B1P20020 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2B1P20020 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2B1P20020 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms