Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms