Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF3P18847 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF3P18847 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms