Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAV1P15498 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAV1P15498 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAV1P15498 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAV1P15498 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAV1P15498 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms