Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT3P12035 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT3P12035 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT3P12035 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT3P12035 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms