Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM10L1P0DMW3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms