Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms