Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IL3P08700 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL3P08700 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL3P08700 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL3P08700 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms