Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NGFRP08138 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NGFRP08138 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NGFRP08138 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms