Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYNP07948 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNP07948 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNP07948 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNP07948 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNP07948 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms