Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3P05106 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms