Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYBBP04839 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYBBP04839 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms