Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TYMSP04818 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TYMSP04818 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TYMSP04818 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms