Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms