Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG9O60271 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPAG9O60271 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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