Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SGSM2O43147 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms