Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TO15178 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TO15178 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TO15178 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TO15178 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TO15178 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TO15178 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TO15178 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TO15178 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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