Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APAF1O14727 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms