Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms