Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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