Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms