Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD1B0YJ81 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms