Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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