Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XIRP2A4UGR9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms