Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms