Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms