Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORCS3Q9UPU3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms