Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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