Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms