Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDRG3Q9UGV2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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