Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms