Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms