Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPF2Q9P2E5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms