Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPZ2Q9P299 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPZ2Q9P299 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPZ2Q9P299 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPZ2Q9P299 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPZ2Q9P299 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPZ2Q9P299 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms