Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms