Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDAP2Q9NXN4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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